February 18, 2011

Identifikasi Karakter Genetik Sidat (Anguilla sp.) di Jawa Barat Berdasarkan Gen Sitokrom B

Yuniar Mulyani, SP., M.Si Fakultas: PERIKANAN Sumberdana: LITMUD Tahun: 2011 Abstrak: Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi karakter genetik Sidat (Anguilla sp). yang beredar di Jawa Barat berdasarkan Cytochrome b untuk menunjang program rekayasa genetik dan pemuliaan ikan tersebut. Sampel sidat yang diperoleh berasal dari Jawa Barat, yaitu dari Sukabumi, Ciamis dan Karawang. Penelitian dilakukan di laboratorium Bioteknologi Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Padjadjaran, pada bulan Mei 2011 sampai November 2011. DNA diisolasi dengan metoda CTAB dan diamplifikasi dengan primer Cyt b1 dan Cyt b2. Hasil PCR yang telah dipurifikasi kemudian dikirimkan ke FIRSTBASE, Malaysia untuk disekuensing. Sampel yang dikirimkan untuk disekuensing adalah sampel yang terpilih dari Anguilla bicolor dari Sukabumi, Karawang dan Ciamis; serta Anguilla marmorata dari Karawang. Hasil sekuensing berupa urutan basa-basa nukleotida penyusun DNA gen cytochrome b. Urutan basa-basa DNA merupakan karakter genetik akan diwariskan dari satu generasi ke generasi berikutnya. Hasil sekuensing kemudian diedit dengan program BioEdit v7.0.9 dan dilanjutkan dengan pensejajaran berganda dengan bantuan GeneBank dan program ClustalW2. Hasil yang diperoleh menunjukkan semua sampel memiliki tingkat kesesuaian dengan data di GeneBank yaitu antara 93-99%. Karakter genetik berupa urutan asam amino penyusun DNA yang diperoleh pada masing-masing sampel memiliki tingkat perbedaan. Panjang basa tiap sampel bervariasi, yaitu antara 947-1375 bp. Kata kunci : Karakter genetik, Cytochrome b, sidat, ClustalW2. Kata kunci:

Artikel terkait